Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1BQ13112 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1BQ13112 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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