Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SPP2Q13103 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPP2Q13103 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPP2Q13103 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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