Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 BLM-206ENST00000559724 4510 ntTSL 1 (best)5.13□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.872e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 BLM-202ENST00000558599 577 ntTSL 33.37□□□□□ -1.872e-6■■■■□ 21.5
ILF3Q12906 AC091976.1-204ENST00000503504 492 ntTSL 510.7□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.631e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 DLC1-206ENST00000509922 455 ntTSL 49.99□□□□□ -0.813e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 DLC1-204ENST00000503161 562 ntTSL 49.91□□□□□ -0.823e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.473e-8■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 LINC01033-203ENST00000517934 306 ntTSL 21.49□□□□□ -2.173e-8■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 KIAA0391-204ENST00000557404 789 ntTSL 313.76□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 KIAA0391-205ENST00000603544 2232 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.542e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.022e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.962e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TP53BP2-205ENST00000465119 465 ntTSL 522.86■■□□□ 1.252e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 VCPKMT-205ENST00000569518 1827 ntTSL 221.64■■□□□ 1.062e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 VCPKMT-204ENST00000491402 1793 ntTSL 1 (best)21.26■□□□□ 0.992e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TELO2-202ENST00000497339 1667 ntTSL 520.18■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 VCPKMT-203ENST00000484763 1849 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TELO2-206ENST00000567427 634 ntTSL 319.77■□□□□ 0.762e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 GIPC1-210ENST00000589497 853 ntTSL 518.81■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 DPP9-209ENST00000597726 570 ntTSL 418.07■□□□□ 0.484e-12■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 DPP9-224ENST00000601764 1909 ntTSL 517.48■□□□□ 0.394e-12■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.238e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.034e-12■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.048e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TELO2-204ENST00000564507 903 ntTSL 314.57□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TP53BP2-206ENST00000472180 467 ntTSL 214.17□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 LCORL-205ENST00000510451 1013 ntTSL 214□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 DPP9-215ENST00000599163 835 ntTSL 513.04□□□□□ -0.324e-12■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TELO2-205ENST00000567423 479 ntTSL 512.05□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.524e-12■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 DPP9-207ENST00000597145 4257 ntTSL 211.75□□□□□ -0.534e-12■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 DPP9-201ENST00000262960 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.64e-12■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 GIPC1-206ENST00000587210 576 ntTSL 511.18□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 DPP9-203ENST00000594671 3851 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.894e-12■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TP53BP2-207ENST00000473135 567 ntTSL 49.18□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 GIPC1-208ENST00000587934 330 ntTSL 58.67□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 VIRMA-205ENST00000521080 6472 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.372e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TP53BP2-213ENST00000496282 481 ntTSL 35.95□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 VIRMA-207ENST00000522263 3219 ntTSL 1 (best)5.85□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.483e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 KDM6A-205ENST00000433797 4324 ntTSL 1 (best)5.68□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.558e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 VIRMA-209ENST00000523405 562 ntTSL 44.73□□□□□ -1.652e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.672e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 KDM6A-203ENST00000414389 4189 ntTSL 54.47□□□□□ -1.692e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 LCORL-208ENST00000637787 9431 ntTSL 53.83□□□□□ -1.82e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 LCORL-204ENST00000510121 486 ntTSL 33.31□□□□□ -1.882e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 WDR12-208ENST00000478869 541 ntTSL 22.86□□□□□ -1.953e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 TFRC-205ENST00000426789 354 ntTSL 32.84□□□□□ -1.952e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.28□□□□□ -2.042e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.062e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.843e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 319.9■□□□□ 0.783e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.723e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.623e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ZGPAT-207ENST00000468235 594 ntTSL 1 (best)18.26■□□□□ 0.513e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.443e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 217.08■□□□□ 0.323e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 214.69□□□□□ -0.063e-7■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-209ENST00000535641 2627 ntTSL 210.95□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-205ENST00000534976 3165 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-214ENST00000539079 1715 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-218ENST00000541887 2400 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-207ENST00000535472 1048 ntTSL 58.97□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-213ENST00000538334 6149 ntTSL 58.66□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-219ENST00000544314 1508 ntTSL 28.45□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-221ENST00000545218 1328 ntTSL 58.24□□□□□ -1.092e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-215ENST00000539612 654 ntTSL 35.76□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 ANAPC5-212ENST00000538223 292 ntTSL 54.9□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.533e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.533e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.533e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.173e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.563e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 21.4
ILF3Q12906 MED25-207ENST00000595185 760 ntTSL 1 (best)14.86□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 21.4
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