Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C1Q12789 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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GTF3C1Q12789 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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GTF3C1Q12789 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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GTF3C1Q12789 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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GTF3C1Q12789 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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GTF3C1Q12789 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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GTF3C1Q12789 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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GTF3C1Q12789 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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