Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCAPQ12770 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms