Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 YKL070WYKL070W 510 nt3.83□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 MUS81YDR386W 1899 nt3.83□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 MUB1YMR100W 1863 nt3.83□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 SPT6YGR116W 4356 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 UBX3YDL091C 1368 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YKL075CYKL075C 1353 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YDR431WYDR431W 312 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 SEC53YFL045C 765 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YGL039WYGL039W 1047 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 AGE2YIL044C 897 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YIL082WYIL082W 873 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 SFT1YKL006C-A 294 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 MPD2YOL088C 834 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YRO2YBR054W 1035 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 RPC40YPR110C 1008 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 SHG1YBR258C 429 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 RSF2YJR127C 4143 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 MYO5YMR109W 3660 nt3.82□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YDR061WYDR061W 1620 nt3.81□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 MFB1YDR219C 1398 nt3.81□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 CRD1YDL142C 852 nt3.81□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 RTT105YER104W 627 nt3.81□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 THG1YGR024C 714 nt3.81□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 IST3YIR005W 447 nt3.81□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 BUD19YJL188C 309 nt3.81□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YLL044WYLL044W 447 nt3.81□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 SUS1YBR111W-A 291 nt3.81□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 SSE2YBR169C 2082 nt3.81□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 FAS1YKL182W 6156 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YCG1YDR325W 3108 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 VPS3YDR495C 3036 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 PBP4YDL053C 558 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 TMA20YER007C-A 546 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 MTC3YGL226W 372 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 PPX1YHR201C 1194 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 IRC21YMR073C 606 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 PDR17YNL264C 1053 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 MPP6YNR024W 561 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YBR071WYBR071W 636 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 TRS120YDR407C 3870 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YCT1YLL055W 1596 nt3.8□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 PEX1YKL197C 3132 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 SHE9YDR393W 1371 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 SRD1YCR018C 666 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 CPR5YDR304C 678 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YER046W-AYER046W-A 330 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YFL065CYFL065C 309 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 VMA21YGR105W 234 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 APQ13YJL075C 417 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 MRP8YKL142W 660 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YKE2YLR200W 345 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 GMC2YLR445W 567 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 PAI3YMR174C 207 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 PFY1YOR122C 381 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YLR352WYLR352W 2424 nt3.79□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.78□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 VFA1YER128W 612 nt3.78□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 PET54YGR222W 882 nt3.78□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 RLP24YLR009W 600 nt3.78□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YMR187CYMR187C 1296 nt3.78□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YNL089CYNL089C 477 nt3.78□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 RFC3YNL290W 1023 nt3.78□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 CSM4YPL200W 471 nt3.78□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 VPS53YJL029C 2469 nt3.78□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 SLK19YOR195W 2466 nt3.78□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 FLO9YAL063C 3969 nt3.78□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 snR5snR5 204 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 BSC1YDL037C 987 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 HLR1YDR528W 1272 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 PRE1YER012W 597 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 SDP1YIL113W 630 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 AIM25YJR100C 984 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 RPL17AYKL180W 555 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 YAR069CYAR069C 294 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 RIM11YMR139W 1113 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 GRE2YOL151W 1029 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 ARF3YOR094W 552 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 MNT3YIL014W 1893 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 SIZ1YDR409W 2715 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 SMC2YFR031C 3513 nt3.77□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 MTR4YJL050W 3222 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 KAP95YLR347C 2586 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 BRE5YNR051C 1548 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 EMI1YDR512C 564 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 YFR054CYFR054C 579 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 RPB9YGL070C 369 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 VEL1YGL258W 621 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 PRS3YHL011C 963 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 YJR087WYJR087W 351 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 TMA19YKL056C 504 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 YET1YKL065C 621 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 YMR254CYMR254C 309 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 YNL109WYNL109W 546 nt3.76□□□□□ -1.81
SLX4Q12098 RPS7AYOR096W 573 nt3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.8 ms