Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 ATG27YJL178C 816 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 RPS28BYLR264W 204 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YNR025CYNR025C 360 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 CIN2YPL241C 807 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.84□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 FUN30YAL019W 3396 nt2.84□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 PFK26YIL107C 2484 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 ENP2YGR145W 2124 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 TCP1YDR212W 1680 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 STT4YLR305C 5703 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 PRE1YER012W 597 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YKL091CYKL091C 933 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 ECM9YKR004C 1134 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YLR297WYLR297W 390 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 REC102YLR329W 795 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YMR141CYMR141C 309 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 SSN8YNL025C 972 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 AAR2YBL074C 1068 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YBL108WYBL108W 306 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 PFY1YOR122C 381 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 RPL33AYPL143W 324 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 PPT2YPL148C 522 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YBR287WYBR287W 1284 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 Q0017Q0017 162 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 MYO5YMR109W 3660 nt2.83□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 STE2YFL026W 1296 nt2.82□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.82□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YGR073CYGR073C 372 nt2.82□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 IKI1YHR187W 930 nt2.82□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 VMA5YKL080W 1179 nt2.82□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YOR152CYOR152C 771 nt2.82□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 MGE1YOR232W 687 nt2.82□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YSP2YDR326C 4317 nt2.82□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 GCD6YDR211W 2139 nt2.81□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 BRR6YGL247W 594 nt2.81□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 SVP26YHR181W 687 nt2.81□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YKL131WYKL131W 522 nt2.81□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 RCN1YKL159C 636 nt2.81□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 ENV10YLR065C 546 nt2.81□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 ECM13YBL043W 774 nt2.81□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YNL109WYNL109W 546 nt2.81□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.81□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 CDH1YGL003C 1701 nt2.81□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 MAK21YDR060W 3078 nt2.81□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 APC5YOR249C 2058 nt2.8□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 BEM4YPL161C 1902 nt2.8□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YHR078WYHR078W 1659 nt2.8□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YGL242CYGL242C 546 nt2.8□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 TDA10YGR205W 873 nt2.8□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 RGI2YIL057C 495 nt2.8□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 RPS21BYJL136C 264 nt2.8□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 PAU23YLR037C 375 nt2.8□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 BET5YML077W 480 nt2.8□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YAP7YOL028C 738 nt2.8□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 snR43snR43 209 nt2.8□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 SLY41YOR307C 1362 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 APC11YDL008W 498 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 USE1YGL098W 738 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 GTR2YGR163W 1026 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 TMA10YLR327C 261 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YOR366WYOR366W 354 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 ARL3YPL051W 597 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 CTP1YBR291C 900 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 BMS1YPL217C 3552 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 TFC1YBR123C 1950 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 MNT3YIL014W 1893 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 TCB2YNL087W 3537 nt2.79□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 BI3Q0115 1554 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 ARP9YMR033W 1404 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 PEX6YNL329C 3093 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 TOM70YNL121C 1854 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 UBC9YDL064W 474 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 AIM18YHR198C 966 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 DLS1YJL065C 504 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 GLG2YJL137C 1143 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YKL123WYKL123W 381 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 RPN13YLR421C 471 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 NBP1YLR457C 960 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 DLT1YMR126C 1029 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YOL114CYOL114C 609 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 NMA111YNL123W 2994 nt2.78□□□□□ -1.96
YPQ1Q12010 YPL150WYPL150W 2706 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 GYL1YMR192W 2163 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 SPP382YLR424W 2127 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RED1YLR263W 2484 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 QCR10YHR001W-A 234 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RPA12YJR063W 378 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 NDL1YLR254C 570 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YLR400WYLR400W 474 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 VMA6YLR447C 1038 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 RHO5YNL180C 996 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 SME1YOR159C 285 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.77□□□□□ -1.97
YPQ1Q12010 ERT1YBR239C 1590 nt2.77□□□□□ -1.97
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