Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGEF1BQ0VAM2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RASGEF1BQ0VAM2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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