Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCBP1Q09161 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms