Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF4Q08170 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms