Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 SPC2YML055W 537 nt3.39□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YMR141CYMR141C 309 nt3.39□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YNL276CYNL276C 396 nt3.39□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 SFG1YOR315W 1041 nt3.39□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 TAF2YCR042C 4224 nt3.39□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 COM2YER130C 1332 nt3.39□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 SLN1YIL147C 3663 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 RUB1YDR139C 234 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 SEC4YFL005W 648 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 MIG2YGL209W 1149 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 ENV10YLR065C 546 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 TMA10YLR327C 261 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 SLM4YBR077C 489 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 snR43snR43 209 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 MDM36YPR083W 1740 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 ENA5YDR038C 3276 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 AVT5YBL089W 1380 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 SPT14YPL175W 1359 nt3.38□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 FMN1YDR236C 657 nt3.37□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 RTT105YER104W 627 nt3.37□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 PEF1YGR058W 1008 nt3.37□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 SDH3YKL141W 597 nt3.37□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt3.37□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YML037CYML037C 1023 nt3.37□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 SPO14YKR031C 5052 nt3.37□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 JJJ1YNL227C 1773 nt3.36□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 NRG1YDR043C 696 nt3.36□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 CBS2YDR197W 1170 nt3.36□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 RPB9YGL070C 369 nt3.36□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 OST5YGL226C-A 261 nt3.36□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.36□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.36□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.36□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.36□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 SPP382YLR424W 2127 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 FAR1YJL157C 2493 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 RPN1YHR027C 2982 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 BNI4YNL233W 2679 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 PIG2YIL045W 1617 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 ERP3YDL018C 678 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 EFG1YGR271C-A 702 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YIR040CYIR040C 333 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YLR076CYLR076C 423 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 INO4YOL108C 456 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 IPP1YBR011C 864 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 RPL33AYPL143W 324 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 TRM82YDR165W 1335 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 PEX5YDR244W 1839 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 SYO1YDL063C 1863 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 TOM70YNL121C 1854 nt3.35□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 FLO1YAR050W 4614 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YCR099CYCR099C 468 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 PRE1YER012W 597 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 AST2YER101C 1293 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YJL114WYJL114W 681 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YLR257WYLR257W 966 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 SFH1YLR321C 1281 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 PDS5YMR076C 3834 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YBL055CYBL055C 1257 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YOR283WYOR283W 693 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 YPR027CYPR027C 834 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 MAK5YBR142W 2322 nt3.34□□□□□ -1.87
SYF1Q04048 TFC1YBR123C 1950 nt3.34□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 VPS41YDR080W 2979 nt3.33□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YGL082WYGL082W 1146 nt3.33□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 VMA7YGR020C 357 nt3.33□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 DAL2YIR029W 1032 nt3.33□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 RPS28BYLR264W 204 nt3.33□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 PRM6YML047C 1059 nt3.33□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 SHG1YBR258C 429 nt3.33□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 Q0255Q0255 1419 nt3.33□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YHR078WYHR078W 1659 nt3.33□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 CIK1YMR198W 1785 nt3.33□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YBP2YGL060W 1926 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 RSM27YGR215W 333 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 MRPL9YGR220C 810 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YIL175WYIL175W 318 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 SRT1YMR101C 1032 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 RHO5YNL180C 996 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 GCY1YOR120W 939 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 THI80YOR143C 960 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 KAR4YCL055W 1008 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 ESA1YOR244W 1338 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 CDH1YGL003C 1701 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 EAP1YKL204W 1899 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 RAX2YLR084C 3663 nt3.32□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 PDR3YBL005W 2931 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YLR001CYLR001C 2589 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 GIS4YML006C 2325 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 RPN3YER021W 1572 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 AEP1YMR064W 1557 nt3.31□□□□□ -1.88
SYF1Q04048 YJL049WYJL049W 1353 nt3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.3 ms