Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DEFA6Q01524 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms