Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP11AP98196 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP11AP98196 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms