Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD1P98174 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FGD1P98174 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FGD1P98174 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FGD1P98174 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FGD1P98174 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGD1P98174 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGD1P98174 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGD1P98174 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGD1P98174 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGD1P98174 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGD1P98174 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD1P98174 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD1P98174 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD1P98174 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD1P98174 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD1P98174 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD1P98174 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD1P98174 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD1P98174 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD1P98174 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms