Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC5P78333 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC5P78333 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC5P78333 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC5P78333 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC5P78333 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC5P78333 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC5P78333 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC5P78333 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC5P78333 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC5P78333 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC5P78333 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC5P78333 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC5P78333 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC5P78333 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPC5P78333 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC5P78333 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC5P78333 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC5P78333 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC5P78333 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC5P78333 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPC5P78333 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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