Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HERVK_113P62684 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms