Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RPS29P62273 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RPS29P62273 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RPS29P62273 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS29P62273 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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