Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCCD1P59942 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCCD1P59942 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms