Protein–RNA interactions for Protein: P59901

LILRA4, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA4P59901 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LILRA4P59901 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LILRA4P59901 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms