Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YBEYP58557 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YBEYP58557 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YBEYP58557 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YBEYP58557 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YBEYP58557 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YBEYP58557 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YBEYP58557 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YBEYP58557 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YBEYP58557 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YBEYP58557 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
YBEYP58557 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YBEYP58557 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
YBEYP58557 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YBEYP58557 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YBEYP58557 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YBEYP58557 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YBEYP58557 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YBEYP58557 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YBEYP58557 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YBEYP58557 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YBEYP58557 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YBEYP58557 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YBEYP58557 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YBEYP58557 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YBEYP58557 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YBEYP58557 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YBEYP58557 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YBEYP58557 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YBEYP58557 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YBEYP58557 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms