Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LOXL3P58215 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LOXL3P58215 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms