Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SIK1P57059 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIK1P57059 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIK1P57059 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIK1P57059 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIK1P57059 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK1P57059 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK1P57059 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK1P57059 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK1P57059 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK1P57059 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK1P57059 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK1P57059 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK1P57059 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK1P57059 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK1P57059 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK1P57059 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK1P57059 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK1P57059 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK1P57059 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK1P57059 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK1P57059 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK1P57059 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK1P57059 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK1P57059 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK1P57059 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK1P57059 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK1P57059 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK1P57059 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK1P57059 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK1P57059 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK1P57059 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK1P57059 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK1P57059 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK1P57059 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK1P57059 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK1P57059 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK1P57059 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK1P57059 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK1P57059 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK1P57059 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK1P57059 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK1P57059 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIK1P57059 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK1P57059 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK1P57059 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK1P57059 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK1P57059 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK1P57059 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK1P57059 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK1P57059 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK1P57059 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK1P57059 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK1P57059 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK1P57059 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK1P57059 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK1P57059 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK1P57059 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK1P57059 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK1P57059 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK1P57059 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK1P57059 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK1P57059 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK1P57059 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK1P57059 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK1P57059 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK1P57059 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms