Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX17P56962 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STX17P56962 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STX17P56962 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX17P56962 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX17P56962 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX17P56962 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX17P56962 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX17P56962 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX17P56962 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX17P56962 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX17P56962 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX17P56962 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX17P56962 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX17P56962 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
STX17P56962 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STX17P56962 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms