Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTBP2P56545 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTBP2P56545 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms