Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTCP1P56278 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MTCP1P56278 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms