Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNU13P55769 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNU13P55769 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNU13P55769 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNU13P55769 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNU13P55769 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNU13P55769 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNU13P55769 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNU13P55769 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNU13P55769 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNU13P55769 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNU13P55769 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNU13P55769 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms