Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELLP55199 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELLP55199 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ELLP55199 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ELLP55199 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ELLP55199 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms