Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRLP54845 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRLP54845 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NRLP54845 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NRLP54845 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRLP54845 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRLP54845 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRLP54845 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRLP54845 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRLP54845 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRLP54845 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRLP54845 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRLP54845 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRLP54845 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRLP54845 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRLP54845 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRLP54845 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NRLP54845 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRLP54845 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms