Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATN1P54259 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATN1P54259 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATN1P54259 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATN1P54259 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATN1P54259 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATN1P54259 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATN1P54259 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATN1P54259 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATN1P54259 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATN1P54259 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATN1P54259 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATN1P54259 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATN1P54259 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATN1P54259 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATN1P54259 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATN1P54259 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATN1P54259 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATN1P54259 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATN1P54259 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATN1P54259 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATN1P54259 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATN1P54259 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATN1P54259 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATN1P54259 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATN1P54259 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATN1P54259 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATN1P54259 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATN1P54259 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATN1P54259 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATN1P54259 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATN1P54259 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATN1P54259 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATN1P54259 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATN1P54259 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATN1P54259 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATN1P54259 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATN1P54259 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATN1P54259 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATN1P54259 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATN1P54259 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATN1P54259 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATN1P54259 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATN1P54259 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATN1P54259 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATN1P54259 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATN1P54259 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATN1P54259 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATN1P54259 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATN1P54259 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATN1P54259 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms