Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATXN1P54253 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms