Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRAP54198 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRAP54198 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRAP54198 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRAP54198 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRAP54198 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRAP54198 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRAP54198 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRAP54198 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRAP54198 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRAP54198 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRAP54198 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRAP54198 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRAP54198 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRAP54198 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRAP54198 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRAP54198 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRAP54198 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRAP54198 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIRAP54198 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRAP54198 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRAP54198 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRAP54198 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRAP54198 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRAP54198 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRAP54198 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRAP54198 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRAP54198 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRAP54198 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRAP54198 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIRAP54198 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIRAP54198 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRAP54198 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRAP54198 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRAP54198 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRAP54198 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRAP54198 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRAP54198 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRAP54198 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRAP54198 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRAP54198 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRAP54198 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIRAP54198 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIRAP54198 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRAP54198 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRAP54198 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRAP54198 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRAP54198 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRAP54198 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRAP54198 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRAP54198 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HIRAP54198 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIRAP54198 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIRAP54198 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms