Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CRYBA4P53673 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRYBA4P53673 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms