Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIMK2P53671 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIMK2P53671 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms