Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPAP53621 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPAP53621 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPAP53621 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPAP53621 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPAP53621 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COPAP53621 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPAP53621 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPAP53621 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPAP53621 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPAP53621 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPAP53621 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPAP53621 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPAP53621 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPAP53621 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPAP53621 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPAP53621 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPAP53621 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPAP53621 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPAP53621 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPAP53621 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPAP53621 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPAP53621 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPAP53621 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPAP53621 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COPAP53621 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COPAP53621 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COPAP53621 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COPAP53621 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPAP53621 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms