Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF135P52742 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF135P52742 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms