Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A2P52657 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms