Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFBP49765 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFBP49765 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VEGFBP49765 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms