Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT5P48643 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT5P48643 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT5P48643 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT5P48643 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT5P48643 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT5P48643 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT5P48643 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT5P48643 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT5P48643 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT5P48643 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT5P48643 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT5P48643 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT5P48643 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT5P48643 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT5P48643 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT5P48643 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT5P48643 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT5P48643 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms