Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10P48553 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10P48553 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC10P48553 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC10P48553 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC10P48553 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC10P48553 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms