Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLMP48507 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLMP48507 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLMP48507 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLMP48507 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLMP48507 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLMP48507 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLMP48507 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLMP48507 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLMP48507 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLMP48507 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCLMP48507 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCLMP48507 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCLMP48507 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLMP48507 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLMP48507 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLMP48507 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLMP48507 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms