Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ME1P48163 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ME1P48163 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ME1P48163 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ME1P48163 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME1P48163 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME1P48163 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME1P48163 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ME1P48163 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME1P48163 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ME1P48163 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ME1P48163 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ME1P48163 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ME1P48163 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ME1P48163 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms