Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RECQLP46063 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RECQLP46063 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RECQLP46063 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RECQLP46063 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RECQLP46063 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RECQLP46063 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RECQLP46063 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RECQLP46063 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RECQLP46063 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RECQLP46063 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RECQLP46063 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RECQLP46063 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RECQLP46063 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RECQLP46063 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RECQLP46063 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RECQLP46063 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RECQLP46063 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RECQLP46063 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RECQLP46063 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RECQLP46063 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms