Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC4P43686 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms