Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHRNA4P43681 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms