Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTGDSP41222 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTGDSP41222 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms