Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDH1P40925 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDH1P40925 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDH1P40925 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDH1P40925 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDH1P40925 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDH1P40925 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MDH1P40925 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MDH1P40925 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MDH1P40925 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MDH1P40925 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MDH1P40925 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDH1P40925 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDH1P40925 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MDH1P40925 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDH1P40925 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDH1P40925 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDH1P40925 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDH1P40925 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MDH1P40925 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MDH1P40925 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.5 ms