Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 INP1YMR204C 1263 nt2.76□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 APD1YBR151W 951 nt2.76□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 RRP7YCL031C 894 nt2.76□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 ARP8YOR141C 2646 nt2.76□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 MPS1YDL028C 2295 nt2.76□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 MRD1YPR112C 2664 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 MUS81YDR386W 1899 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 NUM1YDR150W 8247 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 SKT5YBL061C 2091 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 HOT13YKL084W 351 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 DAD2YKR083C 402 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 ATG16YMR159C 453 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 RPL23AYBL087C 414 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YOL118CYOL118C 309 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 LCL1YPL056C 306 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 snR43snR43 209 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 RGR1YLR071C 3249 nt2.75□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 CDC55YGL190C 1581 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 VHR2YER064C 1518 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 FLO11YIR019C 4104 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 PEX6YNL329C 3093 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 SMX2YFL017W-A 234 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 RPB9YGL070C 369 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 BRR6YGL247W 594 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 PFS1YHR185C 714 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YIL054WYIL054W 318 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 RIF2YLR453C 1188 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 CTL1YMR180C 963 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YOR055WYOR055W 435 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 NEW1YPL226W 3591 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 AI2Q0055 2565 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 SWC4YGR002C 1431 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 CDC5YMR001C 2118 nt2.74□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 IPI3YNL182C 1668 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 FIN1YDR130C 876 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YDR209CYDR209C 414 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 HPA3YEL066W 540 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 GAB1YLR459W 1185 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 BET5YML077W 480 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 AFT2YPL202C 1251 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 SWD3YBR175W 948 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YCL019WYCL019W 5313 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 TRA1YHR099W 11235 nt2.73□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 ENP2YGR145W 2124 nt2.72□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 PET100YDR079W 336 nt2.72□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 SEM1YDR363W-A 270 nt2.72□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 RTT105YER104W 627 nt2.72□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 PPE1YHR075C 1203 nt2.72□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 MRPL38YKL170W 417 nt2.72□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 NNT1YLR285W 786 nt2.72□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YDR131CYDR131C 1671 nt2.72□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 NFT1YKR103W 3657 nt2.72□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 CWC22YGR278W 1734 nt2.71□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 TOR1YJR066W 7413 nt2.71□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 PTP3YER075C 2787 nt2.71□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 SNU23YDL098C 585 nt2.71□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 RPL27AYHR010W 411 nt2.71□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.71□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 PEX18YHR160C 852 nt2.71□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YAP5YIR018W 738 nt2.71□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YNL043CYNL043C 321 nt2.71□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 RPN8YOR261C 1017 nt2.71□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 CTP1YBR291C 900 nt2.71□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 UTP14YML093W 2700 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 APC5YOR249C 2058 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 SKO1YNL167C 1944 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 VPS41YDR080W 2979 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 MMF1YIL051C 438 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 MET14YKL001C 609 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YLR257WYLR257W 966 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 VMA6YLR447C 1038 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YBL108WYBL108W 306 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YOR203WYOR203W 354 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 ERV15YBR210W 429 nt2.7□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YNR066CYNR066C 1311 nt2.69□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 TDA10YGR205W 873 nt2.69□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 TCD1YHR003C 1290 nt2.69□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 ECM13YBL043W 774 nt2.69□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 ATG34YOL083W 1239 nt2.69□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 SWR1YDR334W 4545 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YGR168CYGR168C 1131 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 MRPL9YGR220C 810 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YHR213WYHR213W 597 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 EMC6YLL014W 327 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YAR062WYAR062W 597 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 GRX7YBR014C 612 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 RPB8YOR224C 441 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 RRD2YPL152W 1077 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 ICS2YBR157C 768 nt2.68□□□□□ -1.98
SHQ1P40486 YBR209WYBR209W 318 nt2.68□□□□□ -1.98
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