Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7BP35670 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms