Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN4AP35499 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN4AP35499 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms