Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC1P35251 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC1P35251 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC1P35251 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC1P35251 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC1P35251 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RFC1P35251 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFC1P35251 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC1P35251 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC1P35251 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC1P35251 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC1P35251 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC1P35251 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC1P35251 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC1P35251 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC1P35251 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC1P35251 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC1P35251 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC1P35251 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC1P35251 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC1P35251 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC1P35251 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFC1P35251 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms